Для качественного выявления мутаций гена кальретикулина (CALR) с помощью капиллярного электрофореза на основе фрагментного анализа
Кальретикулин (CALR) является многофункциональным белком, который действует как основной Ca (2 +) -связывающий белок в просвете клеточного эндоплазматического ретикулума. Это также найдено в ядре, предлагая играть роль в регуляции транскрипции. Кальретикулин кодируется геном CALR в хромосоме19. Соматические мутации в экзоне 9 CALR являются вторыми по распространенности приобретенными нуклеотидными изменениями в Ph-негативных миелопролиферативных новообразованиях (MPNs), за исключением полицитемии вера (PV). Две специфические мутации являются наиболее распространенными: L367fs * 46 (мутация типа 1), которая представляет делецию 52 п.н., фланкированную 7 парами оснований идентичной последовательности, и K385fs * 47 (тип 2), которая является результатом вставки 5 п.н. и представляет обратную дупликацию пяти нуклеотидов, предшествующих вставке. В целом, данные типы мутаций со смещением рамки считывания обнаруживаются более чем у 80% всех пациентов с мутантной CALR.
Исследование выполняется при исследовании геномной ДНК.
Оптимальный диапазон концентрации ДНК на реакцию составляет 25-100 нг.
Полимеразная цепная реакция (ПЦР) должна проводиться с помощью твердотельных блоковых ПЦР-термоциклеров любой фирмы, но следующие условия ПЦР адаптированы для термоциклов Bio-Rad.
Проведение электрофореза в капиллярном геле рекомендовано генетическими анализаторами Life Technologies (3130, 3500, 3500xl) с полимером POP7.
Публикации:
1. Nangalia J, Massie CE, Baxter EJ, Nice FL et al. Somatic CALR mutations in myeloproliferative neoplasms with nonmutated JAK2. N Engl J Med. 2013 Dec 19;369(25):2391-405.
2. Klampfl T, Gisslinger H, Harutyunyan AS, Nivarthi H et al. Somatic Mutations of Calreticulin in Myeloproliferative Neoplasms. N Engl J Med. 2013 Dec 19;369(25):2379-90.
3. Lavi N. Calreticulin mutations in myeloproliferative neoplasms. Rambam Maimonides Med J. 2014 Oct 29;5(4):e0035.
Доступные продукты:
CALR MutaPrime FA Kit, 24 tests 24 исследования кат. номер IG-FA-2-24
CALR MutaPrime FA Kit, 48 tests 48 исследований кат. номер IG-FA-2-48
Дополнительные реагенты:
Набор для выделения ДНК Column DNA Kit, 100 выделений кат. номер IG-CDK-100
Реагент Erythrocyte Lysis Solution кат. номер IG-TRL-100
Расценки: по запросу
Реагенты не являются медицинским изделием и предназначены для использования исключительно в исследовательских целях (RUO)